ОФНКристаллография Crystallography Reports

  • ISSN (Print) 0023-4761
  • ISSN (Online) 3034-5510

Определение формы спиральной частицы по данным малоуглового рентгеновского рассеяния: модификация алгоритма “имитации отжига”

Код статьи
10.31857/S0023476123600295-1
DOI
10.31857/S0023476123600295
Тип публикации
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 68 / Номер выпуска 6
Страницы
941-945
Аннотация
Модифицированный алгоритм “имитации отжига”, реализованный в программе DAMMINV, позволяет получать 10–15 различных моделей наночастицы, приближающих данные малоуглового рентгеновского рассеяния. Основой метода является режим перемежающихся весовых коэффициентов целевой функции, в котором балансируются вклады от штрафных коэффициентов, отвечающих за реалистичность модели, и вклад от невязки между экспериментальной и модельной кривыми рассеяния. Исследовано влияние шума на кривых рассеяния на качество восстановления трехмерной формы спирали, а также проведено сравнение результатов с полученными стандартными программами. Метод протестирован на модельных данных, свободных от шума и с наложением пуассоновского шума на примере спиральной частицы с толщиной витков, сопоставимой с характерным размером пространства между ними. Проведен сравнительный анализ восстановленных моделей с 3D-формами, полученными алгоритмами “имитации отжига” в стандартном режиме работы.
Ключевые слова
Дата публикации
14.09.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
10

Библиография

  1. 1. Свергун Д.И., Фейгин Л.А. Рентгеновское и малоугловое рассеяние. М.: Наука, 1986. 280 с.
  2. 2. Petoukhov M.V., Franke D., Shkumatov A.V. et al. // J. Appl. Cryst. 2012. V. 45. P. 342.https://doi.org/10.1107/S0021889812007662
  3. 3. Kirkpatrick S., Gelatt C.D., Vecchi M.P. // Science. 1983. V. 220. P. 671.https://doi.org/10.1126/science.220.4598.671
  4. 4. Svergun D.I. // Biophys J. 1999. V. 78. P. 2879.https://doi.org/10.1016/S0006-3495 (99)77443-6
  5. 5. Franke D., Svergun D.I. // J. Appl. Cryst. 2009. V. 42. P. 342.https://doi.org/10.1107/S0021889809000338
  6. 6. Svergun D.I., Stuhrmann H.B. // Acta Cryst. A. 1991. V. 47. P. 736. https://doi.org/10.1107/S0108767391006414
  7. 7. Svergun D.I., Volkov V.V., Kozin M.B. et al. // Acta Cryst. A. 1996. V. 52. P. 419. https://doi.org/10.1107/S0108767396000177
  8. 8. Shannon C.E., Weaver W. The Mathematical Theory of Communication. University of Illinois Press, 1949. 125 p.
  9. 9. Grant T.D. // Nature Methods. 2018. V. 15. P. 191. https://doi.org/10.1038/nmeth.4581
  10. 10. He H., Liu C., Liu H. // iScience. 2020. V. 23. 100906.
  11. 11. Волков В.В. // Кристаллография. 2021. Т. 66. С. 793. https://doi.org/10.31857/S0023476121050234
  12. 12. Григорьев В.А., Конарев П.В., Волков В.В. // Успехи в химии и химической технологии. 2022. Т. 36. С. 53.
  13. 13. Marsaglia G., Tsang W.W. // SIAM J. Sci. Stat. Comput. 1984. V. 5. P. 349. https://doi.org/10.1137/0905026
  14. 14. Devroye L. // Computing. 1981. V. 26. P. 197. https://doi.org/10.1007/BF02243478
  15. 15. Durbin J., Watson G.S. // Biometrika. 1950. V. 37. P. 409. https://doi.org/10.1093/biomet/37.3-4.409
  16. 16. Durbin J., Watson G.S. // Biometrika. 1951. V. 38. P. 159. https://doi.org/10.2307/2332325
  17. 17. Kozin M., Svergun D. // J. Appl. Cryst. 2001. V. 34. P. 33. https://doi.org/10.1107/S0021889800014126
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека