ОФНКристаллография Crystallography Reports

  • ISSN (Print) 0023-4761
  • ISSN (Online) 3034-5510

Структура комплекса карбоксипептидазы Т из Thermoactinomyces vulgaris с L - фениллактатом

Код статьи
10.31857/S0023476124030067-1
DOI
10.31857/S0023476124030067
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 69 / Номер выпуска 3
Страницы
422-428
Аннотация
С разрешением 1.73 Å определена кристаллическая структура комплекса металлокарбоксипептидазы Т (КПТ) с L-фениллактатом. В отличие от панкреатической карбоксипептидазы А, связывающей одну молекулу L-фениллактата, в комплексе с КПТ лиганд занимает одновременно как S1, так и S1ʹ-сайты активного центра. При этом происходят конформационные изменения, отличающиеся от изменений, вызванных поочередным занятием S1 и S1ʹ-сайтов трет-бутил-оксикарбонил-L-лейцином (BOC-лейцином) и бензилянтарной кислотой. Эти изменения касаются остатков E277, E59, L254, G192, S127 и Y218 и достигают размаха 0.77 Å. Сделан вывод о возможной роли E59 в распознавании и катализе субстратов карбоксипептидазой Т.
Ключевые слова
Дата публикации
14.09.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
64

Библиография

  1. 1. Boehr D.D., Nussinov R., Wright P.E. // Nat. Chem. Biol. 2009. V. 5 (11). P. 789. http://doi.org/10.1038/nchembio.232
  2. 2. Smulevitch S.V., Osterman A.L., Galperina O.V. et al. // FEBS Lett. 1991. V. 291 (1). P. 75. http://doi.org/10.1016/001-5793 (91)81107-j
  3. 3. Grishin A.M., Akparov V.K., Chestukhina G.G. // Biochemistry (Mosc). 2008. V. 73 (10). P. 1140. http://doi.org/10.1134./s0006297908100118
  4. 4. Schechter I., Berger A. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2012. V. 425 (3). P. 497. http://doi.org/10.1016/s0006-291x (67)80055-x
  5. 5. Bown D.P., Gatehouse J.A. // Eur. J. Biochem. 2004. V. 271 (10). P. 2000. http://doi.org/10.1111/j.1432-1033.2004.04113.x
  6. 6. Sukenaga Y., Akanuma H., Suekane C. et al. // J. Biochem. 1980. V. 87 (3). P. 695.
  7. 7. Akparov V.K., Timofeev V.I., Konstantinova G.E. et al. // PLoS One. 2019. V. 14 (12). P. 1. http://doi.org/10.1371/journal.pone.0226636
  8. 8. Akparov V.K., Timofeev V.I., Khaliullin I.G. et al. // FEBS J. 2015. V. 282 (7). P. 1214. http://doi.org/10.1111/febs.13210
  9. 9. Timofeev V.I., Kuznetsov S.A., Akparov V.K. // Biochem. Biokhimiia. 2013. V. 78 (3). P. 252. http://doi.org/10.1134/S0006297913030061
  10. 10. Novagen pET System Manual TB055 7th Ed. Novagen Madison WI. 1997.
  11. 11. Battye T., Kontogiannis L., Johnson O. et al. // Acta Cryst. D. 2011. V. 67. P. 271. http://doi.org/10.1107/S0907444910048675
  12. 12. McCoy A.J., Grosse-Kunstleve R.W., Adams P.D. et al. // J. Appl. Cryst. 2007. V. 40 (4). P. 658. http://doi.org/10.1107/S0021889807021206
  13. 13. Murshudov G.N., Skubák P., Lebedev A.A. et al. // Acta Cryst. D. 2011. V. 67 (4). P. 355. http://doi.org/10.1107/S90744911001314
  14. 14. Emsley P., Lohkamp B., Scott W. et al. //Acta Cryst. D. 2010. V. 66. P. 486. http://doi.org/10.1107/S0907444910007493
  15. 15. Teplyakov A., Polyakov K., Obmolova G. et al. // Eur. J. Biochem. 1992. V. 208 (2). P. 281. http://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1992.tb17184.x
  16. 16. Akparov V.K., Timofeev V.I., Khaliullin I.G. // Biochemistry (Mosc). 2019. V. 83 (12–13). P. 1594. http://doi.org/10.1134/s0006297918120167
  17. 17. Akparov V.K., Timofeev V.I., Maghsoudi N.N. et al. // Crystallography Reports. 2017. V. 62 (2). P. 249. http://doi.org/10.1134/S106377451702002X
  18. 18. Teplyakov A., Wilson K.S., Orioli P. et al. // Acta Cryst. D. 1993. V. 49. P. 534. http://doi.org/10.1107/S0907444993007267
  19. 19. Akparov V., Timofeev V., Khaliullin I. et al. // J. Biomol. Struct. Dyn. 2018. V. 36 (4). P. 956. http://doi.org/10.1080/07391102.2017.1304242
  20. 20. Akparov V.K., Timofeev V.I., Kuranova I.P. // Crystallography Reports. 2011. V. 56 (4). P. 596. http://doi.org/10.1134/S106377451104002X
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека