ОФНКристаллография Crystallography Reports

  • ISSN (Print) 0023-4761
  • ISSN (Online) 3034-5510

Особенности трехмерной реконструкции спиралей по данным малоуглового рентгеновского рассеяния

Код статьи
10.31857/S0023476124060063-1
DOI
10.31857/S0023476124060063
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 69 / Номер выпуска 6
Страницы
971-980
Аннотация
Спиральные частицы представляют интерес из-за схожести с реальными наноструктурами, образующимися в процессах самоорганизации биополимеров (например каррагинанов, ДНК и пр.). С другой стороны, определение структурных параметров таких частиц по данным малоуглового рассеяния затруднено из-за плохой обусловленности обратной задачи. Это показывает практика применения известных программ моделирования шариковыми структурами. Рассмотрены модификация алгоритма поиска в ограниченной области пространства и поведение решений в зависимости от величин параметров целевой функции, отвечающих за связность структуры, типа взвешивания кривой интенсивности рассеяния, ширины углового диапазона данных. Для статистической оценки устойчивости решений применен режим последовательного поиска модели при варьировании величин вкладов штрафных членов. Определены эмпирические зависимости оптимальных значений параметров поиска в зависимости от параметров кривой распределения парных расстояний.
Ключевые слова
Дата публикации
14.09.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
11

Библиография

  1. 1. Свергун Д.И., Фейгин Л.А. Рентгеновское и малоугловое рассеяние. М.: Наука, 1986. 280 с.
  2. 2. Svergun D.I., Stuhrmann H.B. // Acta Cryst. A. 1991. V. 47. P. 736. https://doi.org/10.1107/S0108767391006414
  3. 3. Svergun D.I., Volkov V.V., Kozin M.B. et al. // Acta Cryst. A. 1996. V. 52. P. 419. https://doi.org/10.1107/S0108767396000177
  4. 4. He H., Liu C., Liu H. // iScience. 2020. V. 23. 100906.
  5. 5. Svergun D.I. // Biophys J. 1999. V. 78. P. 2879. https://doi.org/10.1016/S0006 3495(99)77443-6
  6. 6. Franke D., Svergun D.I. // J. Appl. Cryst. 2009. V. 42. P. 342. https://doi.org/10.1107/S0021889809000338
  7. 7. Kirkpatrick S., Gelatt C.D., Vecchi M.P. // Science. 1983. V. 220. P. 671. https://doi.org/10.1126/science.220.4598.671
  8. 8. Григорьев В.А., Конарев П.В., Волков В.В. // Кристаллография. 2023. Т. 68. С. 941. https://doi.org/10.31857/S0023476123600295
  9. 9. Волков В.В. // Кристаллография. 2021. Т. 66. С. 793. https://doi.org/10.31857/S0023476121050234
  10. 10. Григорьев В.А., Конарев П.В., Волков В.В. // Успехи в химии и химической технологии. 2022. Т. 36. С. 53
  11. 11. Rees D.A. Polysaccharides Shapes. London: Chapman and Hall, 1977. 80 p.
  12. 12. Shtykova E.V., Volkov V.V., Konarev P.V. et al. // J. Appl. Cryst. 2003. V. 36. P. 669. https://doi.org/10.1107/S0021889803006198
  13. 13. Shannon C.E., Weaver W. The Mathematical Theory of Communication. University of Illinois Press, 1949. 125 p.
  14. 14. Kozin M., Svergun D. // J. Appl. Cryst. 2001. V. 34. P. 33. https://doi.org/10.1107/S0021889800014126
  15. 15. Taha AA., Hanbury A. // BMC Med Imaging. 2015. V. 15. P. 29. https://doi.org/10.1186/s12880-015-0068-x
  16. 16. Svergun D.I. // J. Appl. Cryst. 1992. V. 25. P. 495.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека